Eesti Laborimeditsiini Ühingu juures tegutsevad järgmised töörühmad ja sektsioonid:
- Terminoloogia töörühm
- LOINC töörühm
- Kliinilise mikrobioloogia sektsioon
- Laboriarstide sektsioon
- Kvaliteedi töörühm
- Laboratoorse hematoloogia töörühm
- Neerufunktsiooni uuringute töörühm
- Südamemarkerite töörühm
- Urogenitaalsete infektsioonide diagnostika töörühm
- Valkude elektroforeetiliste uuringute töörühm
- Kliinilise voolutsütomeetria töörühm
- Mikrobioloogia residentuuri töörühm