ELMÜ juhatus on 7-liikmeline. Aastatel 2019–2022 on juhatuse koosseis alljärgnev:
- Anu Tamm
- Karel Tomberg
- Marge Kütt
- Marina Ivanova
- Monyca Sepp
- prof. Kalle Kisand
- Piret Kedars
Juhatuse esimees on Anu Tamm, anu.tamm@kliinikum.ee
Sekretär on Katrin Reimand, katrin.reimand@kliinikum.ee
ELMÜ revisjonikomisjoni kuuluvad alates 08.12.2011 Ave Lellep, Raili Randoja ja Mehis Bakhoff.